■CycleavePCR Assay Designer について
CycleavePCR Assay Designerは、お持ちのプライマー増幅領域内にCycleavePCR法＊に適したプローブを設計・オンライン注文するためのシステムです。 目的遺伝子の塩基配列、プライマー配列を指定するだけで、プローブ候補を最大10種類設計し、配列・Tm値等の情報を開示します。配列確認後は、そのままWEB上から注文が可能です。＊ CycleavePCR法：サイクリングプローブ法によるリアルタイムPCR
●操作方法 -概略-
1. 条件設定と設計
2. 設計結果
3. カート情報
4. ご注文
詳細な使用方法については、こちらをご覧ください。
1. 条件設定と設計
設計条件（プライマー配列を含む設計対象配列、プライマー配列）を入力してDesignボタンをクリックしてください。
CycleavePCR Primer&Probe条件設定画面
2. 設計結果
設計情報（配列、位置、Tm値など）は、設計結果表示画面で確認可能。
ご希望のプローブについてReporter標識を選択し、Cart Inボタンをクリックしてください。クエンチャーはEclipseを使用します。
Alignmentボタンをクリックすることで、Alignmentを確認できます。
ご希望のプローブについてReporter標識を選択し、Cart Inボタンをクリックしてください。クエンチャーはEclipseを使用します。
Alignmentボタンをクリックすることで、Alignmentを確認できます。
3. カート情報
ご注文の内容を確認してください。Nameは、適宜変更が可能です。
4. ご注文
「レジへ」ボタンを押してオンライン注文フローへ進み、ご注文内容などを確認の上で、「注文」ボタンを押してください。登録メールアドレスに注文確認メールが届きます。
■サイクリングプローブ設計
CycleavePCR Assay Designerには、設計のノウハウを反映させたプログラムが搭載されています。注）プローブの標識の選択
・1波長検出：FAM標識を推奨
■オンラインで設計検索・注文もらくらく
設計後は、プライマー・プローブの配列、位置、Tm値、増幅産物の大きさ、プローブの向きなどの情報をオンライン上で開示し、そのままWEB上から注文が可能です。プローブ合成のみをご希望の場合は、キメラプローブ合成をご利用ください。
■専用試薬との組合せで反応条件の至適化が不要
設計されたプライマー・プローブは、CycleavePCR Starter Kit（製品コード CY505S）または、CycleavePCR Reaction Mix（製品コード CY505A/B）との組合せで使用してください。リアルタイムRT-PCRを行う場合は、RT反応にはPrimeScript RT Master Mix (Perfect Real Time) （製品コード RR036A）またはPrimeScript RT reagent Kit (Perfect Real Time) （製品コード RR037A）の使用をお勧めします。
■各種リアルタイムPCR装置で利用可能
設計されたCycleavePCR用プローブ・プライマーは、Thermal Cycler Dice Real Time System、Smart Cycler Systemをはじめ、各種リアルタイムPCR装置で使用可能です。詳しくは弊社までお問い合わせください。■発注に際してのご注意
CycleavePCR Assay Designerシステムは非常に高い特異性を得られる設計を行っておりますが、候補として提示されるプローブは実験的な確認を行ったものではありませんので、反応性や特異性を保証するものではないことをご了承ください。